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李丹

特别研究员/长聘教轨副教授

  • 电话:+86-021
  • 邮箱:lidan2017@sjtu.edu.cn
  • 地址:徐汇校区基因组学楼305室

学术经历

  • 1998-2002 吉林大学生命科学学院 学士
  • 2002-2008 北京大学生命科学学院 博士 
  • 2008-2014  美国加州大学洛杉矶分校(UCLA) 博士后
  • 2017年至今 pg电子Bio-X研究院

研究方向

神经退行性疾病中蛋白质稳态调控、分相和聚集

蛋白质稳态是维持细胞功能所必需的。在衰老的过程中,蛋白质稳态的失衡与神经退行性疾病发生密切相关。各种神经退行性疾病都对应不同蛋白的异常聚集。在行使正常生物学功能的过程中,很多蛋白会通过分相和聚集,组装成大的分子机器和无膜细胞器。蛋白正常的高分子聚集和病理性异常聚集往往只有一线之隔。衰老过程中细胞内蛋白质量监控的减弱,使得蛋白异常聚集得以积累,进一步损害细胞功能,甚至导致细胞死亡。这一过程在神经退行性疾病的发展过程中不断上演。

本课题组发表的渐冻人症相关FUS肽段0.73埃电子衍射晶体结...

冷冻电镜技术是结构生物学主要技术之一。本课题组聚焦电子衍射(MicroED)、螺旋纤维成像(fibril 3D reconstruction)和断层扫描成像(CryoET)技术的开发和应用。

帕金森症早期诊断和药物开发

神经退行性疾病,如阿尔兹海默症、帕金森症和渐冻人症等,是威胁人类健康的重大神经疾病。神经退行性疾病的发生与衰老密切相关,发生机理涉及复杂的分子、细胞和组织水平的进行性的病变。人类对于复杂神经系统的认识一直是科学研究的重大挑战,对于神经系统疾病发生的理解尤为艰难。然而,欲行其事,先通其理。纵然举步维艰,我们对于神经系统认识的每一次进步,都将让我们离神经推行性疾病的治疗更近。本课题组致力于揭示帕金森症发病的分子机制、分子检测方法的建立和单克隆抗体药物的开发。

代表论著

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    Zhao, K., Li, Y., Liu, Z., Long, H., Zhao, C., Luo, F., Sun, Y., Tao, Y., Su, X.-D., Li, D.#, Li, X.#, Liu, C.#, Parkinson’s disease associated mutation E46K of α-synuclein triggers the formation of a distinct fibril structure. Nature Communications, 2020 In press.

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    Lu J, Zhang S, Ma X, Jia C, Liu Z, Huang C, Liu C#, Li D.#, Structural basis of the interplay between α-synuclein and Tau in regulating pathological amyloid aggregation. J. Biol. Chem. 2020 Apr 13.

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    Sun, Y., Hou, S., Zhao, K., Long, H., Liu, Z., Gao, J., Zhang, Y., Su, X. D., Li, D.#, Liu, C.#. Cryo-EM structure of full-length α-synuclein amyloid fibril with Parkinson’s disease familial A53T mutation, Cell Research, 2020 Apr;30(4):360-362.

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    Gui, X., Luo, F., Li, YC, Zhou, H., Qin,Z., Liu, ZY, Gu, JG, Xie, MY, Zhao, K., Dai, B., Shin, WS, He, JH, He, L., Jiang, L., Zhao, ML, Sun, B., Li, XM, Liu, C.#, Li, D.# Structural basis for reversible amyloids of hnRNPA1 elucidates their role in stress granule assembly, Nature Communications, 2019 May 1;10(1):2006.

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    Lu, J.#, Cao, Q.#, Wang, C.#, Zheng, J., Luo, F., Xie, J., Li, Y., Ma, X., He, L., Eisenberg, D., Nowick, J., Jiang, L.#, Li, D.#, Structure-Based Peptide Inhibitor Design of Amyloid-b Aggregation, Frontiers in Molecular Neuroscience, 2019 Mar 4;12:54.

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    Li, Y.*, Zhao, C.*, Luo, F.*, Liu, Z., Gui, X., Luo, Z., Zhang, X., Li, D.#, Liu, C.#, Li, X.# Amyloid fibril structure of alpha-synuclein determined by cryo-electron microscopy. Cell Research 2018 Sep;28(9):897-903.

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    Li, D.#, Liu, C.#. Better together: a hybrid amyloid signals necroptosis. Cell 2018 Volume 173, Issue 5, p1068–1070, 17 May.

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    Luo, F.*, Gui, X.*, Zhou, H.*, Gu, J., Li, Y., Liu, X., Zhao, M., Li, D.#, Li, X.#, Liu, C.#. Atomic structures of FUS LC domain segments reveal bases for reversible amyloid fibril formation. Nature Struct. Mol. Biol. 2018 Apr;25(4):341-346.

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    Dai, B.#, Li, D.#, Xi, W., Luo, F., Zhang, X., Zou, M., Cao, M., Hu, J., Wang, W., Wei, G., Zhang, Y.*, Liu, C.*Tunable assembly of amyloid-forming peptides into nanosheets as a retrovirus carrier. PNAS 2015 Mar 10;112(10):2996-3001. 

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    Li, D.#, Hiroyasu, F.#, Deng, H., Liu, C., Yaghi, O.M., Eisenberg, D.S. Designed amyloid fibers as materials for selective carbon dioxide capture. PNAS  2014, 111, 191-196.

获奖情况

  • 2018年入选上海市浦江人才计划

教学情况

  • 2006-2007 北京大学,微生物实验课(三年级本科生)助教
  • 2011-2012 UCLA, Structural Molecular Biology (M230B): X-ray Crystallography (一年级研究生)助教
  • 2019 pg电子,科技英语写作与交流,任课教师
  • 国家自然科学基金重大研究计划培育项目《翻译后修饰调控的渐冻人症致病蛋白可逆相分离与不可逆聚集的分子机制研究》 
  • 国家自然科学基金面上项目《α-突触核蛋白与脂质互作的结构基础及在帕金森病中的病理意义》
  • 上海市教委科研创新计划《抑郁症遗传环境机制及模式生物学研究》
  • 上海市科委浦江人才计划《渐冻人症中蛋白压力颗粒形成淀粉样聚集的致病机理研究》 

承担项目

学生培养